مرکز آموزشی، پژوهشی و درمانی شهید هاشمی‌نژاد مشهد در سال ۱۳۳۳ در شمال‌شرقی شهر مشهد و در زمینی به مساحت ۵ هکتار تأسیس گردید. پس از تأسیس، این مرکز به‌عنوان محلی برای اسکان و استقرار بیماران مبتلا به جذام مورد استفاده قرار گرفت. این بیمارستان در قالب یک شهرک مجزا، به بیماران جذامی امکان اسکان داده بود و به این بیماران خدمات رفاهی و درمانی ارائه می کرد. همچنین، یک درمانگاه اختصاصی نیز به منظور رسیدگی به وضعیت این بیماران در این مجموعه فعال بود. هدف از این اقدام، جداسازی بیماران جذامی از سایر افراد جامعه به منظور جلوگیری از شیوع این بیماری و ارائه مراقبت‌های خاص به آن‌ها بود. سر انجام در سال ۱۳۶۰، این مرکز به دانشگاه علوم پزشکی مشهد واگذار گردید. در ابتدای فعالیت رسمی خود به عنوان بیمارستان، با چهار بخش زایشگاه، داخلی، اطفال و اورژانس آغاز به کار کرد. از سال ۱۳۶۰ تا ۱۳۶۸، این مرکز به‌عنوان یکی از بیمارستان‌های معین، پذیرای مجروحان جنگ تحمیلی بود. از سال ۱۳۶۴ تاکنون، بخش‌های مختلف درمانی و تخصصی به‌تدریج به مجموعه اضافه شده‌اند. در سال 1376 مجتمع آموزشی و فرهنگی هاشمی‌نژاد در ضلع شرقی بیمارستان افتتاح گردید. در آبان‌ماه سال ۱۳۹۹، ساختمان جدید بیمارستان از طریق ویدئوکنفرانس توسط رئیس‌جمهور وقت به بهره ‌برداری رسید.

در حال حاضر بیمارستان شهید هاشمی نژاد با داشتن 460 تخت بعنوان یک بیمارستان جنرال و درجه یک در ردیف یکی از بزرگترین مراکز عمده آموزشی ودرمانی سطح کشور قرار دارد. بطوریکه این مرکز علاوه بر درمان بیماران مراجعه کننده بعنوان یک پایگاه تحقیقات آموزش پزشکی و یک مرکز تعلیم و تربیت کارورزان رشته های پزشکی در دو رشته طب اورژانس و طب سرپایی و رشته های پیراپزشکی مامایی، هوشبری و توان بخشی می باشد.

این مرکز تنها بیمارستان دولتی این منطقه است که به صورت شبانه روز مشغول خدمات رسانی به مجاورین و زائرین حضرت رضا(ع) می‌باشد. علاوه بر این، مرکز شهید هاشمی نژاد بالغ بر30  درصد جمعیت  مشهد را تحت پوشش دهی دارد و بیش از 52 درصد آمبولانس ‌های کل مشهد به این مرکز بیماران را منتقل می کنند. این مرکز در 35 بخش فعال و واحد های اداری و پاراکلینیک در حال خدمت رسانی به مردم عزیز مشهد می باشد.

در حال حاضر اين بيمارستان با داشتن بخش هاي اورژانس سوانح، اورژانس مرکزی، جراحی دو بخش داخلی، مسمومین، قلب، جراحي، زنان و زايمان، زایشگاه، جراحی زنان، پست پارتم، اطفال و بخش هاي ويژه CCU ، و چهار بخش ICU ،  مغز و اعصاب و جراحي عمومي، اتاق عمل مرکزی و اتاق عمل قلب باز، ارتوپدي، جراحي مغز و اعصاب، داخلی اعصاب، چشم و گوش و حلق و بيني، همودياليز، انكولوژي و IPD در حال خدمت رساني مي باشد. واحدهاي فعال پاراكلينيك اين بيمارستان عبارتند از: آنژیوگرافی، آزمايشگاه، راديولوژي، سي تي اسكن، اكوكارديوگرافي، شیمی درمانی، تست ورزش، آندوسكوپي و داروخانه. درمانگاه هاي تخصصي اين بيمارستان در دو شيفت صبح و عصر پذيراي بيماران عزيز مي باشند. همچنين دربخش های اورژانس بصورت شبانه روزي آماده ارائه خدمات به هموطنان گرامي هستند.

واحدهای اداری بیمارستان شامل:

ریاست، مدیریت، معاون درمان، معاون آموزشی، معاون پژوهشی، حراست، امور پشتیبانی، حسابداری، کارگزینی، کارپردازی، روابط عمومی، بهداشت محیط، بهداشت حرفه ای، بیمه ها، فناوری اطلاعات، تاسیسات، اقتصاد و درمان، بهبود کیفیت، کارپردازی، مکاتبات قانونی، تجهیزات پزشکی، مدارک پزشکی، بایگانی، پذیرش و ترخیص، مددکاری، رسیدگی به امور بیماران، مشارکتهای مردمی، خدمات عمومی، امور قراردادها، واحد لاندری، واحد سی اس آر، واحد تغذیه و واحد نقلیه می باشد.

مجموعه فرهنگی و آموزشی شهید هاشمی‌نژاد شامل سالن همایش کلاس های آموزشی جهت تدریس اساتید به دانشجویان پزشکی و کلاس‌های آموزشی جهت پرسنل بیمارستان می باشد.

خدمات رفاهی بیمارستان شامل پاویون‌های استراحت پزشکان و دانشجویان، نمازخانه، سرویس بهداشتی، صندلی‌ های مبله برای همراه بیماران و بوفه، ال ای دی در تمام بخش ‌های بستری، لابی ‌های بیمارستان و ورودی ها می باشد.